Are the Heteromyidae paraphyletic? Molecular phylogenetics of extant geomyoid rodents

Resumen

La superfamilia geomyoidea incluye Geomyidae (tuzas: 7 géneros, 42 especies) y Heteromyidae (ratones de abazones, ratones y ratas canguro: 5 géneros, 69 especies).  Los análisis de datos tanto morfológicos como moleculares han confirmado la monofilia de la superfamilia con respecto a otros roedores, pero arrojaron dudas sobre la monofilia recíproca de Geomyidae y Heteromyidae.  Estos últimos se recuperan como parafiléticos en algunas, pero no en todas, las filogenias moleculares, con un apoyo bajo a moderado para los nodos críticos.  Para poner a prueba hipótesis alternativas sobre las relaciones filogenéticas de los geomioideos, buscamos en las bases de datos del NCBI y reunimos dos conjuntos de datos: a) los 13 genes del ADN mitocondrial que codifican proteínas (7 géneros, 13 especies); y b) 3991 loci de Elementos ultraconservados (UCEs; 6 géneros, 9 especies).  En ambos casos, los castores fueron incluidos como grupo externo.  El análisis de Máxima Verosimilitud de loci mitocondriales concatenados recuperó a Geomyidae y Heteromyidae como taxones hermanos, pero el apoyo de “bootstrap” para la monofilia de este último fue sólo del 55%.  Por el contrario, los árboles obtenidos de loci UCE con Máxima Verosimilitud y un método coalescente para múltiples especies (wASTRAL) indicaron que las tuzas eran hermanas de los ratones de abazones (valor de “bootstrap” de 100%, Probabilidad Posterior local de 1), con exclusión de las ratas canguro, que formaban un segundo clado fuertemente apoyado (valor de “bootstrap” de 100%, Probabilidad Posterior local de 1).  Estos hallazgos preliminares son consistentes con la hipótesis de que la familia Heteromyidae es parafilética con respecto a Geomyidae.  Se requiere la inclusión de taxones adicionales en los análisis para confirmar estos resultados.